מה צריך לדעת
- כמה קובצי PDB הם קבצי מסד נתונים של תוכניות.
- פתח אחד עם עורך טקסט או תוכנית כמו Geneious.
- המר לפורמט אחר עם אותה תוכנית שפותחת את קובץ מסד הנתונים הספציפי שלך.
מאמר זה מסביר מהו קובץ PDB, כיצד לפתוח אותו וכיצד להמיר אותו לפורמט אחר.
מהו קובץ PDB?
קובץ עם סיומת הקובץ PDB הוא ככל הנראה קובץ מסד נתונים של תוכנית המשמש לאחסון מידע איתור באגים על תוכנית או מודול, כמו קובץ DLL או EXE. לפעמים הם נקראים קבצי סמלים.
הקובץ ממפה רכיבים והצהרות שונים בקוד המקור למוצר הקומפילציה הסופי שלו, שבו יכול מאפר הבאגים להשתמש כדי למצוא את קובץ המקור ואת המיקום בקובץ ההפעלה שבו הוא אמור לעצור את תהליך איתור הבאגים.
חלק מקבצי PDB עשויים במקום זאת להיות בפורמט הקובץ של Protein Data Bank. אלו הם קבצי טקסט רגיל המאחסנים קואורדינטות לגבי מבני חלבון.
קובצי PDB אחרים עשויים להיווצר בפורמט הקובץ של Palm Database או PalmDOC ולהשתמש בהם עם מערכת ההפעלה הניידת של PalmOS; קבצים מסוימים בפורמט זה משתמשים במקום זאת בסיומת הקובץ. PRC. פורמט נוסף שמשתמש באותה הרחבה הוא Tanida Demo Builder.
איך פותחים קובץ PDB
תוכנות שונות משתמשות בקובץ PDB משלהן כדי לאחסן נתונים בפורמט כלשהו של מסד נתונים מובנה, כך שכל יישום משמש לפתיחת סוג משלה.
Geneious, Quicken, Visual Studio ו-Pegasus הן רק כמה דוגמאות לתוכניות שעשויות להשתמש בקובץ כקובץ מסד נתונים. Radare ו-PDBparse עשויים גם לעבוד.
כמה קבצי PDB מאוחסנים כטקסט רגיל, כמו קבצי מאגר נתונים באגים של Geneious, והם ניתנים לקריאה אנושית לחלוטין אם הם נפתחים בעורך טקסט. אתה יכול לפתוח סוג זה של קובץ PDB עם כל תוכנה שיכולה לקרוא מסמכי טקסט, כמו תוכנית Notepad המובנית ב-Windows. חלק מהצופים והעורכים התואמים אחרים כוללים Notepad++ ו-Brackets.
קובצי PDB אחרים אינם מסמכי טקסט והם שימושיים רק כאשר הם נפתחים עם התוכנית שאליה הם מיועדים. לדוגמה, אם שלך קשור בצורה כלשהי ל-Quicken, נסה להשתמש בתוכנה זו כדי להציג או לערוך אותה. Visual Studio מצפה לראות קובץ PDB באותה תיקיה כמו קובץ ה-DLL או EXE.
תוכל להציג ולערוך קבצי Protein Data Bank ב-Windows, Linux ו-macOS עם Avogadro. תוכנות אלו יכולות לפתוח גם את הקובץ: Jmol, RasMol, QuickPDB ו-USCF Chimera. מכיוון שמדובר בטקסט רגיל, אתה יכול לפתוח אחד גם בעורך טקסט.
Palm Desktop אמור להיות מסוגל לפתוח את הקובץ הזה אם הוא בפורמט הקובץ של Palm Database, אבל ייתכן שתצטרך לשנות את שמו תחילה כדי לקבל את סיומת הקובץ PRC כדי שתוכנית זו תזהה אותו. קליבר היא אפשרות נוספת.
כדי לפתוח קובץ PalmDOC PDB, נסה את STDU Viewer.
Tanida Demo Builder פותח קבצים בפורמט הזה.
איך להמיר קובץ PDB
ככל הנראה לא ניתן להמיר קבצי מסד נתונים של תוכנית לפורמט קובץ אחר, לפחות לא עם כלי ממיר קבצים רגיל. במקום זאת, אם יש יישום כלשהו שיכול להמיר קובץ מסוג זה, זו תהיה אותה תוכנית שיכולה לפתוח אותו.
לדוגמה, אם אתה צריך להמיר את קובץ מסד הנתונים שלך מ-Quicken, נסה להשתמש בתוכנה הזו כדי לעשות זאת. עם זאת, סוג המרה זה כנראה אינו מועיל אך גם אינו נתמך ביישומי מסד נתונים אלה (כלומר, כנראה שלא תצטרך להמיר סוג זה של קובץ PDB לשום פורמט אחר).
ניתן להמיר קבצי בנק נתונים של חלבון לפורמטים אחרים באמצעות MeshLab. כדי לעשות זאת, ייתכן שיהיה עליך להמיר אותו תחילה ל-WRL עם PyMOL מה- File > שמור תמונה בשם > VRML תפריט , ולאחר מכן ייבא את קובץ ה-WRL לתוך MeshLab והשתמש בתפריט File > Export Mesh As כדי להמיר בסופו של דבר את קובץ PDB ל STL או פורמט קובץ אחר.
אם אתה לא צריך שהדגם יהיה בצבע, אתה יכול לייצא את הקובץ ישירות ל-STL עם USCF Chimera (קישור ההורדה נמצא למעלה). אחרת, אתה יכול להשתמש באותה שיטה כמו לעיל (עם MeshLab) כדי להמיר PDB ל-WRL עם USCF Chimera ולאחר מכן לייצא WRL ל-STL עם MeshLab.
להמיר PDB ל-PDB או EPUB, אם יש לך קובץ PalmDOC, אפשר במספר דרכים, אבל הקלה ביותר היא כנראה להשתמש בממיר מקוון כמו Zamzar. אתה יכול להעלות את הקובץ שלך לאותו אתר כדי לקבל את האפשרות להמיר אותו לפורמטים אלה, כמו גם ל-AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT ופורמטים אחרים של קבצי eBook.
כדי להמיר אחד לפורמט FASTA ניתן לעשות עם ממיר PDB ל-FASTA המקוון של Meiler Lab.
אפשר גם לשמור את הקובץ הזה ב-CIF (פורמט מידע קריסטלוגרפי) באינטרנט באמצעות PDBx/mmCIF.
עדיין לא יכול לפתוח אותו?
קבצים שאינם נפתחים עם אף אחד מהכלים מלמעלה, כנראה אינם למעשה קבצי PDB. מה שעשוי לקרות הוא שאתה לא קורא את סיומת הקובץ; חלק מהפורמטים משתמשים בסיומת הדומה מאוד ל-PDB, כאשר הם ממש לא קשורים ולא עובדים אותו הדבר.
לדוגמה, קובץ PDF הוא קובץ מסמך, אבל רוב התוכנות מלמעלה לא יעבדו את הטקסט ו/או התמונות בצורה נכונה אם תנסו לפתוח קובץ עם תוכנות אלו. הדבר נכון גם לקבצים אחרים עם סיומות קבצים מאויתות באופן דומה, כמו DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO וקבצי WPD.
PBD הוא אחר ששייך לתוכנית EaseUS Todo Backup ולכן הוא שימושי רק כאשר הוא נפתח עם אותה תוכנה.
אם אין לך קובץ PDB, חקור את סיומת הקובץ שיש לקובץ שלך כדי שתוכל למצוא את התוכנית המתאימה שפותחת או ממירה אותו.
קריאה מתקדמת בקבצי PDB
תוכל לקרוא הרבה יותר על קבצי מסד נתונים של תוכניות מ-GitHub ו-Wintellect.
יש עוד מה ללמוד גם על קבצי Protein Data Bank; ראה Worldwide Protein Data Bank ו-RCSB PDB.
שאלות נפוצות
- איך אני מתקן את זה כאשר Visual Studio לא מצליח למצוא או לפתוח קבצי PDB? אם אתה רואה הודעה המציינת ש-Visual Studio לא יכול למצוא או לפתוח את קובץ PDB, נסה באמצעות כלי איתור באגים של Visual Studio.עבור אל Tools > Options > Debugging > Symbols ו בחר Microsoft Symbol Servers
- איך אני פותח קובץ PDB באנדרואיד? כדי לפתוח קובץ PDB באנדרואיד, השתמש בקורא קבצים של צד שלישי. הורד את אפליקציית Cool Reader או כל קורא אחר הנתמך בקבצי PDB ב-Google Play.
